
Alors que la brigade voit arriver une nouvelle recrue, le duo ne connaît pas de répit côté c½ur. Jane est enceinte, mais entre les nausées et les meurtres, son quotidien n'est pas simple ! Casey n'est pas encore au courant, et la nouvelle se répand très vite au sein de la famille Rizzoli. Elle comble Angela Rizzoli qui vient de rompre avec Sean Cavannaugh. Maura, quant à elle, fait une rencontre qui ne la laissera pas insensible.

1-Un nouveau départ: Le cadavre d'une jeune joggeuse est retrouvé dans Baxter Park. La jeune femme a été assassinée de treize coups de couteau. La victime, Suzanne Murphy, faisait son jogging avec son fils Brian âgé de 18 mois. L'enfant a disparu. Kidnapping ? Suzanne était divorcée de son mari Raymond Murphy. Les deux s'étaient quittés en mauvais termes.
2-Un seul être vous manque: Le lieutenant Barry Frost est décédé dans un accident de voiture. Ses amis ont du mal à accuser le choc. Jane est choisie pour prononcer son éloge funèbre. Par ailleurs, une jeune femme arrive au commissariat dans un état de grande confusion, sa robe couverte de sang, tenant une arme à la main. Elle remet le pistolet sans opposer de résistance. L'inconnue affirme ne pas se souvenir de son identité.
3-Trop beau pour être vrai: Maura finit par avouer à Jane avoir confié à sa mère qu'elle était enceinte. La nouvelle se répand très vite dans la famille de la jeune femme et dans son entourage professionnel. Mais l'intéressée ne sait toujours pas comment l'annoncer à Casey. Parallèlement, le cadavre d'un homme est retrouvé dans un parc. La victime a été abattue en pleine nuit d'une balle dans la poitrine. Une tombe fraîchement creusée à proximité de la scène de crime indique que le meurtre était prémédité.
4-La fin du monde: Le vice-président d'une entreprise d'électronique est retrouvé mort dans un bunker construit à l'intérieur de son appartement. L'homme était un adepte de la survie. Scott Hines, un ami très proche inquiet de ne pas avoir de ses nouvelles, a signalé sa disparition. Il semble que Peter Baldwin a succombé après avoir inhalé un gaz toxique. Or, la pièce était étanche selon le constructeur, Bob McGrath.
5-Un plan minutieux: La veuve d'un riche homme d'affaires (ex-roi des tabloïds) décédé est retrouvée morte dans son lit. Chelsea Rothburgers était alitée depuis qu'il lui avait été diagnostiqué, deux ans plus tôt, un cancer des ovaires. De prime abord, tout laisse à penser qu'elle serait morte d'une embolie pulmonaire. Mais la légiste Maura Isles (nouvellement nommée à l'université comme professeure) relève des traces de sueurs suspectes. L'autopsie révèle qu'une tierce personne a injecté de l'air à l'aide d'une seringue dans une veine de la victime. Il s'agit d'un meurtre ! La veuve vivait entourée de sa domesticité : Bill Baxter, le majordome ; Polly Scott, la femme de chambre, Larry Gisam, le cuisinier et le chauffeur Brad Oskoff. Le couple a deux héritiers : l'aîné, Larry Jr Rothburgers et le cadet Katler, toxicomane. Ce dernier fait le va-et-vient entre ses cures de désintoxication et la demeure familiale. Les enquêteurs doivent trouver le ou les coupable(s) à l'intérieur de ce petit monde.
6-Un physique à tomber: Très tôt le matin, Judith Barnett est assassinée de plusieurs coups de couteau dans le dos dans la salle de gymnastique de sa villa. Son mari Alan Barnett, chirurgien dentiste, était en train de s'occuper d'une patiente. Il raconte que sa femme, ancienne obèse, s'entraînait plus que de raison. Elle avait perdu 45 kilos. Dans la matinée, elle avait rendez-vous avec leur homme à tout faire, Luis Benitez. L'homme possède un casier judiciaire et a fait ses affaires pour quitter la ville le matin même selon sa mère. C'est Frankie Rizzoli qui parvient à le retrouver. Benitez dit avoir découvert le cadavre en venant travailler, mais sachant qu'il serait le principal suspect, il a préféré prendre la fuite. Selon la légiste adjointe, le tueur a frappé dans le dos et portait une combinaison. Et Luis Benitez serait beaucoup trop grand pour avoir porté les coups de couteau.
7-Lecture explosive: Jane Rizzoli enquête sur le meurtre d'un libraire de livres rares. Le cadavre de Brendan McHale a été retrouvé au petit matin dans sa boutique par son unique employé. Ricky Kelly était chargé d'ouvrir le magasin. La victime, torturée toute la nuit, est morte d'un arrêt respiratoire dû à un choc violent. Son tortionnaire a tenté de le réanimer avec un produit dont il a jeté le flacon dans une poubelle des alentours. De toute évidence, McHale est mort avant d'avoir pu révéler au malfrat l'information qu'il était venu chercher.
8-Fugue en ado mineur: Le département de police accueille un nouvel agent. Il s'agit d'une femme policière, Nina Holliday. Sa première enquête concerne le couple Allen, Sidney et Johnson. Le mari et la femme ont été assassinés la même nuit à quelques heures d'intervalles dans des lieux différents avec... la même arme ! Ce qui laisse supposer qu'ils ont eu affaire au même tueur, un professionnel. L'époux dirigeait une start-up.
9-Boire le vin jusqu'à la lie: Les restes d'une femme momifiée mettent les compétences de l'équipe à rude épreuve. Jane travaille depuis sa chambre d'hôpital, avec le soutien de Maura et de sa famille, et tente de se remettre d'une perte dévastatrice.
10-Renaître de ses cendres: L'équipe aide Korsak à enquêter sur une affaire très ancienne. Jane refuse de considérer qu'elle n'est pas prête à reprendre du service et utilise quelques moyens peu conventionnels pour rester impliquée.
11-Coup de chaud sur Boston: Une vague de chaleur s'est abattue sur Boston. La vie se déroule au ralenti. Le lieutenant Rizzoli est confrontée à une affaire de meurtre qui la laisse perplexe.
12-L'accusateur accusé: Une vague de chaleur s'est abattue sur Boston. La vie se déroule au ralenti. Le lieutenant Rizzoli est confrontée à une affaire de meurtre qui la laisse perplexe.
13-Un pont vers l'avenir: Carole Westcourt se montre totalement indifférente au sort de son mari, qui a sauté d'un pont dans la mer. Pendant ce temps, un chalutier fait son entrée dans le port avec le lieutenant Jane Rizzoli et Paul Westcourt à son bord.
14-Casse-tête anatomique: Un pied humain, puis un tronc sont retrouvés dans le port de Boston. Les deux membres ont été découpés à la scie mécanique. Les investigations menées par une spécialiste informatique apprennent que, depuis 2007, onze pieds humains ont été rejetés sur les plages de Colombie-Britannique.
15-Fin limier: Le propriétaire d'un magasin de vêtements meurt sous les yeux de ses employés en tombant par-dessus la rampe d'escalier. L'autopsie révèle rapidement que Dylan Blyer est mort empoisonné. Une camionnette a été vue quittant la scène de crime à toute vitesse.
16-Aux yeux de tous: Un jeune homme d'une trentaine d'année, Todd Reynolds, est retrouvé mort au bord de la route. L'homme s'était arrêté pour vérifier son moteur. Todd a été assassiné le crâne fracassé à l'aide d'une barre de fer.
17-L'homme-loup solitaire: Deux hommes se disputent une place de parking. L'un s'écroule mort d'une balle tirée en pleine poitrine. Son interlocuteur n'avait pas d'arme. Et l'analyse de l'angle de tir indique que le coup a été tiré d'un lieu élevé. Un chien de la brigade cynophile permet de localiser l'endroit où se tenait le sniper. Une balle est récupérée. L'homme utilise du gros calibre. Une seconde victime est à déplorer : Jeremy Fritz, patron d'une boîte de courtage en bourse.
18-Révélations: Un promoteur immobilier, Ronald Wallace, décède dans d'étranges circonstances. Il s'adonnait à des jeux sexuels avec son épouse dans une chambre d'hôtel lorsqu'il s'est écroulé sur le sol. Sa tête a, semble-t-il, heurté un objet contendant. Maura Isles affirme que le coup porté était très violent. Il y avait forcément une troisième personne dans la chambre. Il s'agit donc d'un meurtre.